基因组目标区域重测序
使用Illumina Genome AnalyzerⅡ对基因组挑选某些特定区域进行测序。节约了测序成本和时间，有助于发现大量个体基因变异、靶向筛选核酸序列等。
人全外显子测序
人类基因组中外显子占人类基因组的百分之一点几，外显子测序就是捕获这些区域进行测序，可以获得很好的测序深度，在医学应用中有利于发现致病的基因改变的信息。
多态性标记开发(SNP 分子鉴定 近等基因系）
高通量开发不同个体间的SNP、InDel标记，实现全基因组均匀覆盖，特别适合近等基因系、单片段代换系中相应片段的鉴定。
LncRNA基因组分析
LncRNA-长链非编码RNA（Long noncoding RNA）是一类长度超过200nt的RNA分子，它们极少具有蛋白编码潜能。
Small RNA测序
Small RNA 是一类长度18-30nt的非编码RNA，主要包括miRNA、siRNA、piRNA三大类。使用二代测序平台对其进行测序及分析。