TMT标记质谱分析是一种基于同位素标记和高分辨率质谱技术的蛋白质定量分析方法。TMT标记质谱分析的基本原理是利用TMT标签的同位素特性进行多重定量。TMT标签由三个关键部分组成：反应基团（可与肽段共价结合）、质量归一化区（确保不同标签的理化性质相同）和报告离子（用于定量）。在质谱分析过程中，不同样本的肽段被不同的TMT标签标记，在一级质谱（MS1）阶段，所有标记肽的质量基本相同，因此可以同时进入质谱分析。在二级质谱（MS2）阶段，TMT标签会释放出质量特异的报告离子，通过比较这些报告离子的强度，可以计算不同样本中蛋白质的相对丰度。这种方法使得TMT标记质谱分析能够在单次实验中定量多达16个样本（TMTpro 16plex），极大提高了实验效率和数据一致性。相较于传统的蛋白质定量方法，如Western blot、ELISA或标签自由定量（Label-free）方法，TMT标记质谱分析具有高通量、灵敏度高、重复性好等优势。

一、TMT标记质谱分析的应用

1、生物医学研究

TMT标记质谱分析在疾病机制研究、蛋白质生物标志物发现和精准医疗领域具有广泛应用。例如，在肿瘤研究中，TMT技术可用于比较癌症患者和健康个体的蛋白质表达差异，筛选可能的癌症标志物。在神经科学研究中，该技术用于研究阿尔茨海默病、帕金森病等神经退行性疾病的蛋白质变化，为疾病诊断和治疗提供新的视角。

2、药物开发与靶点筛选

在药物研发中，TMT标记质谱分析可用于鉴定药物作用靶点、分析药物处理前后的蛋白质表达变化，并评估药物的毒性。例如，在抗癌药物开发过程中，TMT技术可帮助研究人员确定某种药物是否能够特异性地调控某一类关键蛋白，并筛选出最有效的候选化合物。此外，该技术还可用于研究个性化用药，通过分析患者蛋白质表达特征，预测对不同药物的响应程度，从而优化治疗方案。

3、免疫学与疫苗研究

TMT标记质谱分析已被广泛应用于免疫系统研究和疫苗开发。例如，在免疫应答研究中，TMT可用于分析T细胞、B细胞在不同免疫状态下的蛋白质表达变化，为理解免疫调控机制提供分子层面的信息。在疫苗研发中，该技术可以用于比较疫苗接种前后蛋白质组的变化，优化疫苗设计，提高免疫保护效果。

二、TMT标记质谱分析的数据处理

TMT标记质谱分析的实验数据需要经过严格的生物信息学处理，以确保定量的准确性。典型的数据分析流程包括：

1、质谱数据处理

利用Proteome Discoverer、MaxQuant等软件进行谱图匹配，识别蛋白质序列。

2、数据归一化

去除实验偏差，提高不同样本间的可比性。

3、统计分析

利用生物统计学方法筛选差异表达蛋白，结合功能富集分析（如GO分析、KEGG通路分析）解析其生物学意义。

4、蛋白质网络分析

利用蛋白质互作数据库（如STRING）构建蛋白互作网络，揭示蛋白质在生物学过程中的调控关系。

百泰派克生物科技致力于提供高质量的TMT分析服务，我们依托先进的高分辨率质谱仪和专业的数据分析团队，为科研机构和企业提供精准的蛋白质定量分析。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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